Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBE1Q9UJT0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBE1Q9UJT0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBE1Q9UJT0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms