Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RIMS3Q9UJD0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RIMS3Q9UJD0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms