Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PLXNA1Q9UIW2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLXNA1Q9UIW2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms