Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CTNNA3Q9UI47 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTNNA3Q9UI47 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms