Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DDX20Q9UHI6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX20Q9UHI6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms