Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHORDC1Q9UHD1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHORDC1Q9UHD1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms