Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC3

ASIC3, Acid-sensing ion channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC3Q9UHC3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ASIC3Q9UHC3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC3Q9UHC3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC3Q9UHC3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC3Q9UHC3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC3Q9UHC3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC3Q9UHC3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC3Q9UHC3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC3Q9UHC3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC3Q9UHC3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC3Q9UHC3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC3Q9UHC3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC3Q9UHC3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC3Q9UHC3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC3Q9UHC3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ASIC3Q9UHC3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms