Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TCF20Q9UGU0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCF20Q9UGU0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms