Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLIP2Q9UDT6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLIP2Q9UDT6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms