Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C9orf78Q9NZ63 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
C9orf78Q9NZ63 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
C9orf78Q9NZ63 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
C9orf78Q9NZ63 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
C9orf78Q9NZ63 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
C9orf78Q9NZ63 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
C9orf78Q9NZ63 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
C9orf78Q9NZ63 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
C9orf78Q9NZ63 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
C9orf78Q9NZ63 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
C9orf78Q9NZ63 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
C9orf78Q9NZ63 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
C9orf78Q9NZ63 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
C9orf78Q9NZ63 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
C9orf78Q9NZ63 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C9orf78Q9NZ63 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27■■□□□ 1.91
C9orf78Q9NZ63 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C9orf78Q9NZ63 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C9orf78Q9NZ63 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
C9orf78Q9NZ63 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
C9orf78Q9NZ63 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
C9orf78Q9NZ63 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C9orf78Q9NZ63 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms