Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZDHHC3Q9NYG2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZDHHC3Q9NYG2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms