Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDIT4Q9NX09 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDIT4Q9NX09 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms