Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC39A9Q9NUM3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC39A9Q9NUM3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms