Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GINM1Q9NU53 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GINM1Q9NU53 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms