Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SAMSN1Q9NSI8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SAMSN1Q9NSI8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SAMSN1Q9NSI8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms