Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
VPS45Q9NRW7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VPS45Q9NRW7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VPS45Q9NRW7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.7 ms