Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SNX15Q9NRS6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX15Q9NRS6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms