Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
DUOX1Q9NRD9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DUOX1Q9NRD9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DUOX1Q9NRD9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DUOX1Q9NRD9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DUOX1Q9NRD9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
DUOX1Q9NRD9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DUOX1Q9NRD9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DUOX1Q9NRD9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DUOX1Q9NRD9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DUOX1Q9NRD9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DUOX1Q9NRD9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DUOX1Q9NRD9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DUOX1Q9NRD9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DUOX1Q9NRD9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms