Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEC31BQ9NQW1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEC31BQ9NQW1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEC31BQ9NQW1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEC31BQ9NQW1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEC31BQ9NQW1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEC31BQ9NQW1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEC31BQ9NQW1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEC31BQ9NQW1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEC31BQ9NQW1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEC31BQ9NQW1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SEC31BQ9NQW1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SEC31BQ9NQW1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SEC31BQ9NQW1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SEC31BQ9NQW1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms