Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRDM8Q9NQV8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRDM8Q9NQV8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRDM8Q9NQV8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRDM8Q9NQV8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRDM8Q9NQV8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRDM8Q9NQV8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRDM8Q9NQV8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRDM8Q9NQV8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRDM8Q9NQV8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRDM8Q9NQV8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRDM8Q9NQV8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PRDM8Q9NQV8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRDM8Q9NQV8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRDM8Q9NQV8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRDM8Q9NQV8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRDM8Q9NQV8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRDM8Q9NQV8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRDM8Q9NQV8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRDM8Q9NQV8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRDM8Q9NQV8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRDM8Q9NQV8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PRDM8Q9NQV8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms