Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RTN4Q9NQC3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTN4Q9NQC3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTN4Q9NQC3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms