Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FZD3Q9NPG1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FZD3Q9NPG1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FZD3Q9NPG1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms