Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN3

TMEM8A, Post-GPI attachment to proteins factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM8AQ9HCN3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM8AQ9HCN3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM8AQ9HCN3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms