Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PLXNA4Q9HCM2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLXNA4Q9HCM2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms