Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NRDE2Q9H7Z3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRDE2Q9H7Z3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NRDE2Q9H7Z3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRDE2Q9H7Z3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRDE2Q9H7Z3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRDE2Q9H7Z3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRDE2Q9H7Z3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRDE2Q9H7Z3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRDE2Q9H7Z3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NRDE2Q9H7Z3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRDE2Q9H7Z3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRDE2Q9H7Z3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRDE2Q9H7Z3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRDE2Q9H7Z3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRDE2Q9H7Z3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRDE2Q9H7Z3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRDE2Q9H7Z3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NRDE2Q9H7Z3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NRDE2Q9H7Z3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NRDE2Q9H7Z3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NRDE2Q9H7Z3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NRDE2Q9H7Z3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NRDE2Q9H7Z3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NRDE2Q9H7Z3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NRDE2Q9H7Z3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NRDE2Q9H7Z3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NRDE2Q9H7Z3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NRDE2Q9H7Z3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NRDE2Q9H7Z3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NRDE2Q9H7Z3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NRDE2Q9H7Z3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NRDE2Q9H7Z3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NRDE2Q9H7Z3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NRDE2Q9H7Z3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NRDE2Q9H7Z3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NRDE2Q9H7Z3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NRDE2Q9H7Z3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NRDE2Q9H7Z3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NRDE2Q9H7Z3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NRDE2Q9H7Z3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NRDE2Q9H7Z3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NRDE2Q9H7Z3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NRDE2Q9H7Z3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms