Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYNCQ9H7C4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNCQ9H7C4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNCQ9H7C4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms