Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINC00597Q9H2U6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00597Q9H2U6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms