Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SLIRPQ9GZT3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLIRPQ9GZT3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLIRPQ9GZT3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLIRPQ9GZT3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLIRPQ9GZT3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLIRPQ9GZT3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLIRPQ9GZT3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLIRPQ9GZT3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLIRPQ9GZT3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLIRPQ9GZT3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLIRPQ9GZT3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLIRPQ9GZT3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLIRPQ9GZT3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLIRPQ9GZT3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLIRPQ9GZT3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLIRPQ9GZT3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLIRPQ9GZT3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLIRPQ9GZT3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms