Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR1EQ9GZS1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR1EQ9GZS1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms