Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC39A8Q9C0K1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC39A8Q9C0K1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms