Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCSER1Q9C0I3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCSER1Q9C0I3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
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