Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SEMA4CQ9C0C4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA4CQ9C0C4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms