Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIM5Q9C035 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM5Q9C035 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM5Q9C035 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms