Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC3Q9BY71 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC3Q9BY71 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms