Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
KDM5DQ9BY66 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
KDM5DQ9BY66 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
KDM5DQ9BY66 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
KDM5DQ9BY66 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
KDM5DQ9BY66 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
KDM5DQ9BY66 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
KDM5DQ9BY66 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC32.07■■■□□ 2.72
KDM5DQ9BY66 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
KDM5DQ9BY66 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
KDM5DQ9BY66 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM5DQ9BY66 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM5DQ9BY66 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM5DQ9BY66 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM5DQ9BY66 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM5DQ9BY66 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM5DQ9BY66 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM5DQ9BY66 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM5DQ9BY66 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM5DQ9BY66 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM5DQ9BY66 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
KDM5DQ9BY66 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM5DQ9BY66 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM5DQ9BY66 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM5DQ9BY66 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM5DQ9BY66 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM5DQ9BY66 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM5DQ9BY66 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM5DQ9BY66 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM5DQ9BY66 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM5DQ9BY66 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM5DQ9BY66 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM5DQ9BY66 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM5DQ9BY66 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM5DQ9BY66 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
KDM5DQ9BY66 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
KDM5DQ9BY66 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
KDM5DQ9BY66 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
KDM5DQ9BY66 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
KDM5DQ9BY66 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
KDM5DQ9BY66 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
KDM5DQ9BY66 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
KDM5DQ9BY66 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
KDM5DQ9BY66 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
KDM5DQ9BY66 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
KDM5DQ9BY66 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
KDM5DQ9BY66 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
KDM5DQ9BY66 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
KDM5DQ9BY66 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
KDM5DQ9BY66 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms