Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL25A1Q9BXS0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL25A1Q9BXS0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms