Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RSG1Q9BU20 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RSG1Q9BU20 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms