Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC39A3Q9BRY0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC39A3Q9BRY0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC39A3Q9BRY0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC39A3Q9BRY0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC39A3Q9BRY0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC39A3Q9BRY0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC39A3Q9BRY0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC39A3Q9BRY0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC39A3Q9BRY0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC39A3Q9BRY0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC39A3Q9BRY0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms