Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
RIOK1Q9BRS2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RIOK1Q9BRS2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIOK1Q9BRS2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms