Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ39

DDX50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX50Q9BQ39 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms