Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RETNLBQ9BQ08 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms