Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PHOX2BQ99453 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHOX2BQ99453 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms