Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UHRF1Q96T88 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UHRF1Q96T88 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UHRF1Q96T88 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UHRF1Q96T88 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UHRF1Q96T88 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UHRF1Q96T88 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UHRF1Q96T88 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UHRF1Q96T88 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UHRF1Q96T88 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UHRF1Q96T88 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UHRF1Q96T88 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UHRF1Q96T88 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UHRF1Q96T88 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UHRF1Q96T88 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UHRF1Q96T88 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UHRF1Q96T88 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UHRF1Q96T88 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UHRF1Q96T88 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UHRF1Q96T88 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UHRF1Q96T88 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UHRF1Q96T88 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UHRF1Q96T88 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UHRF1Q96T88 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UHRF1Q96T88 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UHRF1Q96T88 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UHRF1Q96T88 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UHRF1Q96T88 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms