Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CSRNP1Q96S65 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CSRNP1Q96S65 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms