Protein–RNA interactions for Protein: Q96QE5

TEFM, Transcription elongation factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEFMQ96QE5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TEFMQ96QE5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TEFMQ96QE5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TEFMQ96QE5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TEFMQ96QE5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TEFMQ96QE5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TEFMQ96QE5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TEFMQ96QE5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TEFMQ96QE5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TEFMQ96QE5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TEFMQ96QE5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TEFMQ96QE5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TEFMQ96QE5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TEFMQ96QE5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TEFMQ96QE5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TEFMQ96QE5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TEFMQ96QE5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TEFMQ96QE5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TEFMQ96QE5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TEFMQ96QE5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms