Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CFAP57Q96MR6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP57Q96MR6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms