Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NSMCE2Q96MF7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms