Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMD8Q96LT4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SAMD8Q96LT4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMD8Q96LT4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMD8Q96LT4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMD8Q96LT4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMD8Q96LT4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMD8Q96LT4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMD8Q96LT4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMD8Q96LT4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMD8Q96LT4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAMD8Q96LT4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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SAMD8Q96LT4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMD8Q96LT4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMD8Q96LT4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMD8Q96LT4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAMD8Q96LT4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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SAMD8Q96LT4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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SAMD8Q96LT4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMD8Q96LT4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMD8Q96LT4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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SAMD8Q96LT4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMD8Q96LT4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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SAMD8Q96LT4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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SAMD8Q96LT4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMD8Q96LT4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMD8Q96LT4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMD8Q96LT4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMD8Q96LT4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMD8Q96LT4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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SAMD8Q96LT4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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SAMD8Q96LT4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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SAMD8Q96LT4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD8Q96LT4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD8Q96LT4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD8Q96LT4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD8Q96LT4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD8Q96LT4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD8Q96LT4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD8Q96LT4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD8Q96LT4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD8Q96LT4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD8Q96LT4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD8Q96LT4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD8Q96LT4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD8Q96LT4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD8Q96LT4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD8Q96LT4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMD8Q96LT4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SAMD8Q96LT4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SAMD8Q96LT4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SAMD8Q96LT4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SAMD8Q96LT4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SAMD8Q96LT4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SAMD8Q96LT4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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