Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX27Q96L92 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX27Q96L92 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms