Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CAPNS2Q96L46 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPNS2Q96L46 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPNS2Q96L46 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPNS2Q96L46 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPNS2Q96L46 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPNS2Q96L46 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPNS2Q96L46 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPNS2Q96L46 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPNS2Q96L46 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPNS2Q96L46 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPNS2Q96L46 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPNS2Q96L46 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPNS2Q96L46 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPNS2Q96L46 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPNS2Q96L46 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPNS2Q96L46 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPNS2Q96L46 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPNS2Q96L46 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPNS2Q96L46 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPNS2Q96L46 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPNS2Q96L46 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPNS2Q96L46 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPNS2Q96L46 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPNS2Q96L46 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPNS2Q96L46 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPNS2Q96L46 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPNS2Q96L46 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPNS2Q96L46 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPNS2Q96L46 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPNS2Q96L46 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPNS2Q96L46 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPNS2Q96L46 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPNS2Q96L46 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPNS2Q96L46 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPNS2Q96L46 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPNS2Q96L46 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPNS2Q96L46 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPNS2Q96L46 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPNS2Q96L46 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPNS2Q96L46 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPNS2Q96L46 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPNS2Q96L46 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPNS2Q96L46 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
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